Tijdens de oorlogsjaren werd het onderwijs aan de Middelbare Kunstnijverheidsschool voor zover mogelijk voortgezet. Directeur Jef Scheffers probeerde door middel van administratieve handelingen zijn docenten en leerlingen uit handen van de bezetter te houden. Het ging dan om bijvoorbeeld de ‘verhuizing’ van een leerling naar Amsterdam of de noodzakelijke aanwezigheid van een docent, met de expliciete mededeling dat deze zich nooit kritisch zou hebben uitgelaten over de bezetter. Leerling Frans Slijpen werd zo vervroegd naar de Rijksacademie gestuurd. Eenzelfde houding betrachtte Scheffers tegenover leerlingen, van wie de ouders gekende collaborateurs waren, zoals Frans Vos, jaargenoot en vriend van Rob Stultiens.
Directeur Scheffers deed het nodige, om zowel leerlingen als docenten uit de wind te houden van de Duitse bezetter.
Stilleven geschilderd door Jef Scheffers, 1941. Het werd in 1945 opgenomen in een grote nationale bevrijdingstentoonstelling in het Rijksmuseum. Scheffers liet zijn leerlingen, onder wie Ger Lataster en Jef Diederen en Pieter Defesche, kennismaken met schilderkunst van onder anderen Cézanne, De Vlaminck, Rik Wouters en hun generatiegenoten.